軸封用來防止玻璃反應釜的主體與攪拌軸之間的泄漏。軸封有填料密封和機械密封。目前，市場上的玻璃反應釜采用的大都是機械密封。
填料密封是旋轉壓緊螺栓時壓蓋壓緊填料，使填料變形并緊貼在軸表面上，達到密封目的。在化工生產中，軸封容易泄漏，一旦有毒氣體溢出會污染環境，甚至發生事故，因而需要控制好壓緊力。填料的彈性變形要大，使填料緊貼轉軸，對轉軸產生收縮力，同時還要求填料有足夠的圈數。
機械密封是由動靜環、彈簧加荷裝置及輔助密封圈四個部分組成。由于彈簧力的作用使動緊緊壓在靜環上，當軸旋轉時，彈簧加荷裝置及動環等零件隨軸一起旋轉，而靜環則固定在座架上靜止不動，動環與靜環相接觸的環形密封端面阻止了物料的泄漏。玻璃反應釜采用的機械密封，結構雖然復雜了點，但是密封效果非常好。
